Licencia Médica Electrónica (LME) en Chile 2026: Cómo Funciona y Tramitarla

La Licencia Médica Electrónica (LME) es el documento digital que acredita la incapacidad laboral temporal de un trabajador. La emite el médico directamente al sistema del Fondo Nacional de Salud (Fonasa) o la Isapre sin que el trabajador deba hacer nada: el empleador recibe la notificación automáticamente. El trabajador puede ver y revisar su LME en la plataforma del operador que la emitió, o consultarla en su isapre o en Fonasa.

Chile migó de la licencia médica en papel a la electrónica de forma paulatina desde 2010. Hoy la gran mayoría de las licencias son electrónicas, pero muchos trabajadores no saben exactamente cómo funciona el proceso, qué ocurre si el empleador la rechaza y cuánto tarda el subsidio en llegar.

Cómo se genera una LME: el proceso paso a paso

  1. El médico emite la licencia: en la consulta, el médico ingresa la licencia directamente al sistema electrónico de COMPIN. Indica el diagnóstico, los días de reposo y el tipo de licencia.
  2. Notificación automática al empleador: el empleador recibe la LME por el portal del empleador y tiene 3 días hábiles para pronunciarse (autorizar o rechazar).
  3. Pronunciamiento del empleador: si autoriza, la LME sigue su curso normal. Si rechaza, el caso pasa a COMPIN (en Fonasa) o la Isapre para resolución.
  4. Resolución de COMPIN o Isapre: verifican los antecedentes y resuelven si el subsidio procede. El plazo es de 3 días hábiles.
  5. Pago del subsidio: una vez resuelta, la entidad (Fonasa o Isapre) calcula el subsidio y lo paga al trabajador, generalmente en la misma cuenta donde recibe el sueldo.

Cuánto paga el subsidio por incapacidad laboral

El subsidio por incapacidad laboral (SIL) reemplaza el sueldo durante el reposo. El monto depende del promedio de remuneraciones de los últimos 3 meses antes del inicio de la licencia.

  • Trabajadores dependientes (con contrato): el SIL equivale al promedio de las remuneraciones imponibles de los últimos 3 meses. El empleador paga los primeros 3 días (período de carencia para licencias de entre 4 y más días en algunos contratos); Fonasa o Isapre paga desde el primer o cuarto día según la normativa.
  • Trabajadores independientes (honorarios): desde 2019 tienen acceso al subsidio si cotizan. El monto se calcula sobre la base imponible de cotizaciones.
  • Tope: el subsidio tiene un tope máximo equivalente a la rentabilidad del Fondo del Seguro Social de Salud. En 2026 el tope es de aproximadamente $3.160.000 mensuales.

Tipos de licencia médica electrónica

TipoMotivoQuién la resuelve
Tipo 1Enfermedad o accidente comúnCOMPIN (Fonasa) o Isapre
Tipo 2Medicina preventivaCOMPIN (Fonasa) o Isapre
Tipo 3Pre y postnatalCOMPIN (Fonasa) o Isapre
Tipo 4Enfermedad grave del niño menor de un añoCOMPIN (Fonasa) o Isapre
Tipo 5Accidente del trabajo o del trayectoMutualidad (ACHS, Mutual de Seguridad, IST) o ISL
Tipo 6Enfermedad profesionalMutualidad o ISL
Tipo 7Patologías del embarazoCOMPIN (Fonasa) o Isapre

¿Qué puede hacer el trabajador si el empleador rechaza la LME?

El empleador puede rechazar la LME si considera que el diagnóstico no justifica el reposo o que el trabajador no se ajustó al procedimiento. Sin embargo, ese rechazo no es definitivo: el caso pasa a COMPIN o la Isapre, que tienen la palabra final.

Si COMPIN resuelve a favor del trabajador, el subsidio procede aunque el empleador haya rechazado. Si la COMPIN rechaza, el trabajador puede presentar un recurso de reposición ante ella dentro de 5 días hábiles y, si lo mantiene, apelar a la Superintendencia de Seguridad Social (SUSESO). Si la rechazó la Isapre, el reclamo va a la COMPIN dentro de 15 días hábiles.

Cómo consultar el estado de tu LME

Puedes revisar el estado de tu licencia en cualquier momento:

  • En la plataforma del operador de licencias electrónicas con ClaveÚnica: verás el listado de todas tus LME emitidas, el estado actual (enviada, autorizada, rechazada, pagada) y el monto del subsidio.
  • En el portal de Fonasa o tu Isapre con tu cuenta de usuario.
  • Llamando al 600 360 3000 (Fonasa) si tienes dudas sobre una licencia específica.

Preguntas frecuentes sobre la licencia médica electrónica

¿El empleador puede despedirme mientras tengo licencia médica?

La licencia no es un fuero, pero mientras estés con licencia por enfermedad común, accidente del trabajo o enfermedad profesional el empleador no puede despedirte por necesidades de la empresa ni por desahucio (artículo 161 del Código del Trabajo). Otras causales, como el vencimiento del plazo de un contrato a plazo fijo, no quedan bloqueadas por la licencia. El fuero maternal es otra cosa: nace del embarazo, no de la licencia. Si el despido ocurre mientras estás de licencia y parece vinculado a ella, hay indicios de despido discriminatorio.

¿Cuánto se demora en llegar el pago del subsidio?

Depende de si hubo rechazo del empleador y de la carga de trabajo de COMPIN o la Isapre. En casos sin complicaciones, el subsidio puede pagarse entre 15 y 30 días después del término de la licencia. Si hubo rechazo y apelación, puede tardar 2-3 meses.

¿Puedo salir de casa con licencia médica?

Durante el reposo médico, en principio debes guardar reposo en el domicilio indicado. Sin embargo, no existe una prohibición legal absoluta de salir: la licencia no impide moverse si la condición lo permite. Lo que sí puede ocurrir es que si COMPIN hace una visita domiciliaria y no te encuentra, puede ser motivo de rechazo o revisión de la licencia.


Consulta también la guía sobre cómo tramitar licencias médicas en Fonasa e Isapre o el postnatal y la licencia maternal.

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