En Chile, la licencia médica es el documento que respalda legalmente una ausencia laboral por motivos de salud. Ya sea que estés afiliado a Fonasa o a una Isapre, conocer cómo se tramita online, cómo consultar el estado de tu solicitud y qué hacer en caso de rechazo es clave para asegurar el subsidio por incapacidad laboral.
A continuación, te explicamos paso a paso el proceso de tramitación digital y te entregamos enlaces oficiales para que gestiones tu licencia médica de forma clara y segura.

¿Qué es una licencia médica y para qué sirve?
La licencia médica es un documento extendido por un profesional de la salud que certifica que un trabajador no puede desempeñar sus funciones por razones médicas. Este documento permite acceder a un subsidio por incapacidad laboral, el cual reemplaza parte de tu remuneración durante el período en que estás con reposo indicado.
Dependiendo de tu sistema de previsión, el trámite y pago de la licencia lo gestiona Fonasa (a través de la COMPIN) o tu Isapre.
Tipos de licencia médica en Chile
Existen distintos tipos de licencia médica según el motivo de la ausencia laboral. Es importante que tu médico emita la licencia con el tipo correcto, ya que de eso depende la duración máxima y el monto del subsidio:
- Tipo 1 – Enfermedad o accidente común: la más frecuente. Cubre enfermedades no laborales, cirugías, recuperaciones post-operatorias y cualquier condición que impida trabajar temporalmente.
- Tipo 2 – Medicina preventiva: para exámenes preventivos autorizados (como el EMPA en Fonasa).
- Tipo 3 – Pre y postnatal (maternal): cubre el descanso de maternidad. El prenatal dura 6 semanas antes de la fecha probable de parto y el postnatal 12 semanas después. Además, existe el postnatal parental de 12 semanas adicionales (ampliable a 18 con media jornada).
- Tipo 4 – Enfermedad grave del hijo menor de 1 año: permite a la madre (o al padre si ella lo cede) ausentarse del trabajo para cuidar al hijo enfermo, con subsidio completo.
- Tipo 5 – Accidente del trabajo o enfermedad profesional: la tramita la mutual de seguridad correspondiente (ACHS, Mutual de Seguridad, IST), no Fonasa ni la Isapre.
- Tipo 6 – Patología del embarazo: para complicaciones médicas durante el embarazo que requieran reposo antes del prenatal.
Plazos para presentar la licencia médica
Los plazos son estrictos y si no los cumples, puedes perder el derecho al subsidio:
- Trabajadores dependientes: debes presentar la licencia a tu empleador dentro de los 2 días hábiles siguientes a la fecha de inicio del reposo. Tu empleador tiene 3 días hábiles para enviarla a Fonasa o la Isapre.
- Trabajadores independientes: debes presentarla directamente ante Fonasa, la Isapre o la COMPIN dentro de los 2 días hábiles desde el inicio del reposo.
- Resolución: Fonasa/COMPIN o la Isapre tienen hasta 30 días corridos para pronunciarse. Si no responden en ese plazo, la licencia se entiende aprobada.
¿Cuánto pagan por subsidio de incapacidad laboral?
El subsidio de incapacidad laboral es el dinero que recibes mientras estás con licencia médica. Su cálculo depende de tu remuneración:
- Se calcula sobre el promedio de tus remuneraciones de los últimos 3 meses anteriores al inicio de la licencia.
- Los 3 primeros días de licencia no se pagan (son los llamados «días de carencia»), salvo en licencias de tipo 3 (maternal), tipo 4 (enfermedad del hijo) y tipo 6 (patología del embarazo), donde se pagan desde el primer día.
- El monto máximo de subsidio está topado en 79,3 UF mensuales aproximadamente.
- Si tu licencia es mayor a 10 días, el pago lo realiza directamente Fonasa o la Isapre. Si es menor, lo paga tu empleador y luego él solicita el reembolso.
Tramitación online de licencia médica en Fonasa
Si estás afiliado a Fonasa, tu licencia médica debe ser validada por la COMPIN (Comisión de Medicina Preventiva e Invalidez). Actualmente, este trámite se puede realizar completamente en línea.
Ingreso y seguimiento de licencias en Fonasa
Normalmente, el médico enviará tu licencia médica de forma electrónica. Luego de eso, puedes revisar su estado aquí:
🔗 Consulta de licencias médicas en Fonasa
Solo necesitas tu RUT y número de folio o el código de licencia. Desde esa misma plataforma podrás ver si tu licencia fue aprobada, rechazada o si está en evaluación.
¿Cómo saber si Fonasa pagará mi licencia?
El pago de la licencia médica en Fonasa se realiza mediante depósito en cuenta bancaria o retiro presencial, dependiendo de los datos que hayas entregado. Para revisar si ya fue cursado el pago:
🔗 Estado y pago de licencias en www.fonasa
También puedes revisar el seguimiento desde la plataforma Mi Fonasa.
Tramitación online de licencia médica en Isapres
Si estás afiliado a una Isapre como Banmédica, Colmena, Consalud, Cruz Blanca, entre otras, el proceso de validación puede variar ligeramente. Sin embargo, la mayoría también permite hacer el seguimiento digital de tus licencias.
Consulta del estado de licencia en Isapres y COMPIN
Tu licencia puede ser aprobada directamente por la Isapre o derivada a la COMPIN si hay dudas sobre su validez. Para conocer su estado, puedes ingresar a:
🔗 Mi Licencia – Plataforma oficial para Isapres y Fonasa
Este sitio permite verificar el estado con RUT y número de licencia.
También puedes consultar directamente en los sitios de tu Isapre:
¿Qué hacer si la Isapre rechaza mi licencia?
Si la Isapre rechaza tu licencia médica, tienes derecho a apelar. Para eso, debes presentar los antecedentes médicos directamente ante la COMPIN, quien revisará el caso.
🔗 Formulario de apelación COMPIN
Es importante realizar este trámite dentro del plazo indicado en la resolución de rechazo, generalmente 15 días hábiles.
¿Qué es la COMPIN y cuándo interviene?
La COMPIN es el organismo que fiscaliza y resuelve licencias médicas cuando hay dudas, rechazos o apelaciones. Interviene principalmente cuando:
- Hay rechazo por parte de Fonasa o Isapre.
- La licencia médica tiene observaciones clínicas.
- Se solicita prórroga o licencia prolongada.
Puedes contactar directamente con tu COMPIN más cercana o hacer consultas a través del sitio oficial:
🔗 Portal COMPIN – Ministerio de Salud
Recomendaciones en caso de rechazo o demoras
- Verifica que el médico haya ingresado correctamente la licencia.
- Conserva una copia del formulario de licencia médica.
- Haz seguimiento frecuente en la plataforma correspondiente.
- Apela a tiempo si recibes un rechazo con el que no estás de acuerdo.
Enlaces útiles y canales de contacto
- 📍 Mi Fonasa – Consulta de licencias
- 📍 COMPIN – Portal oficial
- 📍 Superintendencia de Salud – Reclamos y consultas
Preguntas frecuentes sobre licencias médicas
¿Me pueden despedir estando con licencia médica?
La licencia médica no es un fuero laboral: legalmente tu empleador puede despedirte mientras estás con licencia, aunque debe pagar las indemnizaciones correspondientes. Sin embargo, la licencia maternal y las de tipo 4 y 6 sí otorgan fuero maternal, que impide el despido durante el embarazo y hasta un año después de terminado el descanso postnatal.
¿Cuántos días de licencia puedo tener?
No hay un límite legal absoluto de días. Cada licencia puede durar lo que el médico determine médicamente necesario. Sin embargo, licencias prolongadas o reiteradas pueden ser revisadas por la COMPIN, que puede citar a evaluación presencial o reducir los días autorizados.
¿Puedo trabajar mientras estoy con licencia médica?
No. Trabajar durante una licencia médica es una infracción que puede resultar en la anulación del subsidio, la devolución de los montos pagados e incluso sanciones legales. Esto incluye realizar trabajos remunerados para un segundo empleador.
¿Qué hago si rechazan mi licencia?
Tienes 15 días hábiles desde la notificación del rechazo para apelar ante la COMPIN (si te la rechazó la Isapre) o ante la Superintendencia de Seguridad Social (SUSESO) si te la rechazó la COMPIN. La apelación se puede hacer online en milicenciamedica.cl o en superdesalud.gob.cl.
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